FAT16 または FAT32 ファイル システムを使用するパーティションがある場合は、convert コマンドを使用して NTFS に変換することができます。NTFS に変換しても、パーティション上のデータには影響はありません。

「convert E: /fs:ntfs」と入力すると E ドライブが NTFS 形式に変換されます。